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双子叶植物VQ基因家族的全基因组鉴定 与盐胁迫下的表达模式分析
严涵薇,陈风,潘枫,项艳
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(安徽农业大学林学与园林学院,合肥 230036)
摘要:
VQ基因来自植物特有的VQ基因家族,因其在拟南芥的生长发育及胁迫调控中起关键作用而被广泛关注。目前,关于VQ基因家族在双子叶植物中的研究鲜有报道。利用生物信息学的方法,在全基因组水平上,系统地鉴定了拟南芥、番木瓜、葡萄和杨树4种双子叶模式植物的VQ基因家族成员,并从序列属性、进化机制和盐胁迫下基因表达水平等角度分析了VQ基因在物种内和物种间的特征。VQ基因的研究为进一步筛选具有重要性状的功能基因,同时对于物种的进化机制研究具有重要意义。
关键词:  VQ基因  双子叶植物  鉴定  进化  表达模式
DOI:10.13610/j.cnki.1672-352x.20181023.011
投稿时间:2018-08-27
基金项目:国家自然科学基金(31800557), 安徽省教育厅科研项目(KJ2016A832)和安徽省自然科学基金项目(1608085QC65)共同资助。
Genome-wide identification and expression pattern on salt stress of VQ gene family in dicots
YAN Hanwei,CHEN Feng,PAN Feng,XIANG Yan
(School of Forestry and Landscape Architecture, Anhui Argricultural University, Hefei 230036)
Abstract:
The VQ gene in the VQ gene family that is unique to plants, has been widely concerned for its key role in the growth and development and the regulation of stresses of Arabidopsis thaliana. Few studies focusing on VQ gene family in dicots have been reported so far. This study systematically identified VQ members of the family in model organisms arabidopsis, papaya, grape and poplar, and analyzed in terms of the sequence feature, evolution mechanism and gene expression level under salt stress to explore the VQ genes’ characteristic between species and within species using bioinformatics on the genome-wide analysis. The study of VQ gene makes a significance on further screening functional genes with important traits and in the study of evolution mechanism of species.
Key words:  VQ gene  dicots  identification  evolution  expression pattern

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