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苞叶姜的nrDNA ITS2和cpDNA psbB-H序列 分子进化特点的分析
李聪,王英强
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(华南师范大学生命科学学院,广东省植物发育生物工程重点实验室,广州 510631;华南师范大学生命科学学院,广东省植物发育生物工程重点实验室,广州 510631; 华南师范大学生命科学学院,广东省高等学校生态与环境科学重点实验室,广州 510631)
摘要:
采用改良的CTAB法从硅胶干燥的苞叶姜(Pyrgophyllum yunnanense)叶片中提取总DNA,对nrDNA ITS2和cpDNA psbB-H区域进行PCR扩增、测序和序列分析,初步研究2套植物基因组的变异速率。nrDNA ITS2序列长224 bp,有变异位点3处,变异位点百分率为1.339%,(G + C)含量为60.7%。cpDNA psbB-H序列长623~625 bp,有2个碱基插入缺失,变异位点8处,变异位点百分率1.284%,(G +C)含量为33.9%,cpDNA核苷酸多态性(0.00551)比nrDNA(0.00295)高。苞叶姜的这2个片段,变异速率相近,遗传分化指数相同(Fst=1.000),居群间高度分化。ITS2序列和psbB-H序列单倍型中性检验结果一致,表明苞叶姜居群处于长期稳定状态。psbB-H错配分布(Mismatch-distribution)分析,表示苞叶姜的现有分布范围近期可能经历了居群扩张。因此,苞叶姜的谱系地理学研究可结合nrDNA ITS2序列和cpDNA psbB-H序列来分析。
关键词:  苞叶姜  ITS2序列  psbB-H序列
DOI:10.13610/j.cnki.1672-352x.20171017.016
基金项目:国家自然科学基金委-广东省联合基金重点支持项目(U1301213), 广东省自然科学基金重点项目(7117864)和高等学校全国优秀博士学位论文作者专项(2007B26)共同资助。
Characterizing molecular evolution of Pyrgophyllum yunnanense (Zingiberaceae ) based on nrDNA ITS2 and cpDNA psbB-H sequence analysis
LI Cong,WANG Yingqiang
(Guangdong Provincial Key Laboratory of Biotechnology for Plant Development, College of Life Sciences, South China Normal University, Guangzhou 510631;Guangdong Provincial Key Laboratory of Biotechnology for Plant Development, College of Life Sciences, South China Normal University, Guangzhou 510631; Key Laboratory of Ecology and Environment Science in Guangdong Higher Education, College of Life Sciences, South China Normal University, Guangzhou 510631)
Abstract:
Key words:  Pyrgophyllum yunnanense  ITS2 sequence  psbB-H sequence

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