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苹果IRAP反应体系的建立和指纹图谱构建
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摘要:
利用已获得的苹果Ty1-copia类逆转座子LTRs建立了苹果逆转座子间扩增多态性(IRAP)技术体系,对影响IRAP-PCR扩增结果的若干因子进行了研究.优化的反应体系包含:2.5 μL 10×buffer,50 ng模板DNA,2.5 mmol·L-1 Mg2+,0.2 mmol·L-1 dNTPs,0.4 μmol·L-1引物,1 U Taq DNA聚合酶,反应体积为25 μL;优化的PCR扩增程序为:94℃ 2 min; 94℃ 1 min,退火1 min,72℃ 2 min,循环35次;72℃延伸10 min;退火温度根据引物温度设定.该IRAP体系分别用于‘元帅'和‘富士'的短枝和着色芽变指纹图谱的分析,构建的指纹图谱可以作为芽变鉴定的依据,表明这些突变可能系逆转座子转座插入或逆转座子间重组所致.
关键词:  苹果  逆转座子  指纹图谱
DOI:
基金项目:国家自然科学基金,安徽农业大学稳定与引进人才科研启动专项基金?
Establishment of the inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) reaction system and construction of fingerprint in Malus genus
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Abstract:
Key words:  IRAP-PCR

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