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人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析Ⅱ.基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱
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摘要:
进一步研究基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱之间的关系.多变量统计分析发现,人类1号染色体选择性剪接基因和普通剪接基因密码子使用变化都呈现单一趋势,且它们之间的密码子使用模式也非常相似,推测的高表达基因确实偏爱以 C或G结尾的密码子,基因表达水平与密码子使用偏爱之间的关联也达到显著水平.因此,人类1号染色体高表达基因密码子的使用偏爱可能主要被翻译选择所决定.此外,基因长度与密码子偏爱水平之间也存在高度相关,说明相对较短的基因具有较高的密码子使用偏爱,翻译选择可能缩短了高表达基因的长度从而提高翻译效率.
关键词:  可变剪接  基因表达  基因长度  翻译选择  突变偏爱  alternative splicing  gene expression  gene length  translational selection  mutation bias  人类  染色体  可变剪接  基因表达  同义密码子  使用分析  平和  基因长度  密码子使用  Chromosome  Human  Genes  Codon Usage  Shape  Length  Pattern  result  reduction  enhancement  efficiency
DOI:
基金项目:中国博士后科学基金
Synonymous Codon Usage of Both Alternatively and Commonly Spliced Genes in Human Chromosome 1 Ⅱ:Expression Pattern and Gene Length Shape Codon Usage
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Abstract:
Key words:  alternative splicing,gene expression,gene length,translational selection,mutation bias

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