东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A蛋白的分子特性及系统进化分析
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国家自然科学基金(32172792), 国家现代农业产业技术体系专项资金项目(CARS-44-KXJ7), 福建省自然科学基金 (2022J01131334), 福建农林大学硕士生导师团队项目(郭睿), 福建农林大学科技创新专项基金(郭睿), 福建省大学生创新创业训练计划项目(X202310389074, X202310389077)共同资助。


Analysis of molecular characteristics and phyletic evolution of Nosema ceranae KRAB-A protein
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    为明确KRAB-A的分子特性并进行东方蜜蜂微孢子虫与其他物种KRAB-A蛋白的系统进化分析,以期丰富KRAB-A的基本信息,使用NCBI数据库中的ORF工具预测KRAB-A蛋白的氨基酸序列。利用ExPASy网站上的相关软件预测和分析KRAB-A蛋白的亲水性、信号肽、磷酸化位点、二级结构及三级结构。通过Mega11.0软件采用邻接法构建基于KRAB-A蛋白的系统进化树。结果显示,KRAB-A基因可编码1 018个氨基酸;KRAB-A蛋白的分子式为C5314H8526N1522O1556S43,分子量约为120.00 kDa,等电点为9.33,脂溶系数为79.20,亲水性为-0.75;KRAB-A含有41个丝氨酸、21个酪氨酸和16个苏氨酸磷酸化位点,1个H2C2模体,但不含有信号肽;KRAB-A含44.40%的α-螺旋,5.40%的β-转角,16.50%的延伸及33.69%的无规卷曲;蜜蜂微孢子虫的1个KRAB-A蛋白(NAPIS_ORF00138)与明球囊霉的2个KRAB-A蛋白(RCL2_000589200和RCL2_003114000)中存在与东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A蛋白中相同的H2C2模体;东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A(AAJ76_2380003054)与其姐妹种蜜蜂微孢子虫KRAB-A(NAPIS_ORF01514)聚为一支。研究结果明确了东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A基因的分子特性,揭示KRAB-A可能是一种亲水性蛋白和胞内蛋白,东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A(AAJ76_2380003054)与蜜蜂微孢子虫KRAB-A(NAPIS_ORF01514)间具有很高的保守性,为进一步的功能研究提供依据。

    Abstract:

    To enrich the basic information of KRAB-A gene by analyzing the molecular characteristics of KRAB-A and performing phylogenetic analysis of KRAB proteins in N. ceranae and other species, the amino acids sequence of KRAB-A was predicted using ORF tool in NCBI database. Related software in ExPASy website were employed to predict and analyze the hydrophilicity, signal peptide, phosphorylation site, secondary structure and tertiary structure of KRAB-A.Phylogenetic tree based on KRAB-A protein was constructed by Mega 11.0 software using Neighbor-joining method. The results demonstrated that KRAB-A gene can encode 1018 amino acids; the molecular formula of KRAB-A protein was C5314H8526N1522O1556S43, the molecular weight was 120.00 kDa, the hydrophilic point was 9.33, the lipid solubility coefficient was 79.20, and the hydrophilicity was -0.75; KRAB-A contained 41 serine phosphorylation sites, 21 tyrosine phosphorylation sites, 16 threonine phosphorylation sites, one H2C2 motif, and no

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  • 在线发布日期: 2023-09-06